RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497287.5

GPATCH4-208, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 3

Gene GPATCH4, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-208	ENST00000497287	ARSI	Q5FYB1	569 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	LGSN	Q5TDP6	509 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	USP45	Q70EL2	814 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	KCNMB4	Q86W47	210 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	LRRC6	Q86X45	466 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	PPM1N	Q8N819	430 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMIE	Q8NEW7	156 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	CALML6	Q8TD86	181 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZBTB9	Q96C00	473 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	PGM2	Q96G03	612 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	CERS2	Q96G23	380 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	PAFAH2	Q99487	392 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMEM245	Q9H330	911 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TREX1	Q9NSU2	369 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	DKK3	Q9UBP4	350 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	MYO10	Q9HD67	2058 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPATCH4-208	ENST00000497287	COL4A3	Q01955	1670 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	TSPAN11	A1L157	253 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CCDC78	A2IDD5	438 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287		K7EQS6	105 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	MAN2B1	O00754	1011 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC7A4	O43246	635 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	LDB2	O43679	373 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	RNF40	O75150	1001 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	SIN3B	O75182	1162 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	VAPB	O95292	243 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRKCG	P05129	697 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	EPHX1	P07099	455 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	PIRT	P0C851	137 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	ERVK-10	P10266	1014 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	HLA-E	P13747	358 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	IL9	P15248	144 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CTPS1	P17812	591 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CNTF	P26441	200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC8A1	P32418	973 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	HADHA	P40939	763 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	IL12RB1	P42701	662 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRAME	P78395	509 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24	3e-6	■■■■□ 23.5
GPATCH4-208	ENST00000497287	PON2	Q15165	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMED2	Q15363	201 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CNGA3	Q16281	694 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	UGP2	Q16851	508 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	GRTP1	Q5TC63	336 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	CHPF	Q8IZ52	775 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	KRT222	Q8N1A0	295 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	STK40	Q8N2I9	435 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF366	Q8N895	744 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24

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