RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SPATA20Q8TB22 786 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 MORC4Q8TE76 937 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TANKQ92844 425 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 FBXL8Q96CD0 374 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CSF3RQ99062 836 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NOX4Q9NPH5 578 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 DONSONQ9NYP3 566 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SIX4Q9UIU6 781 aa3.23□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GRID2O43424 1007 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NDUFS7O75251 213 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 RFPL2O75678 378 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 URODP06132 367 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 LINC00271P0C7V0 271 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SRCP12931 536 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ETFAP13804 333 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 AMD1P17707 334 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 EDN2P20800 178 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 AGAP20933 346 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 DGKAP23743 735 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 POU1F1P28069 291 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 CDH15P55291 814 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 EFNB1P98172 346 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TROAPQ12815 778 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 VEPH1Q14D04 833 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NAA35Q5VZE5 725 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SMC5Q8IY18 1101 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PLD5Q8N7P1 536 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NEK9Q8TD19 979 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 C3orf30Q96M34 536 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NODALQ96S42 347 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 NUF2Q9BZD4 464 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 EBF2Q9HAK2 575 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 VDAC3Q9Y277 283 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.22□□□□□ -1.89
CMC1-211ENST00000495428 GAGE10A6NGK3 116 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 IFNL4K9M1U5 179 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 NCAM2O15394 837 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 PYGLP06737 847 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 GALTP07902 379 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 MMP2P08253 660 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 NLRP5P59047 1200 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 TLE2Q04725 743 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 ZBTB17Q13105 803 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 BIRC3Q13489 604 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 TAF12Q16514 161 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 MMEL1Q495T6 779 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 SLC22A25Q6T423 547 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 LINGO2Q7L985 606 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 NOXA1Q86UR1 476 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 BEST2Q8NFU1 509 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 FIG4Q92562 907 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 CD101Q93033 1021 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 FEM1CQ96JP0 617 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 ZNF570Q96NI8 536 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 BBS4Q96RK4 519 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 PSMD1Q99460 953 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.21□□□□□ -1.9
CMC1-211ENST00000495428 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms