RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491833.5

SSR4-212, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 921 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-212ENST00000491833 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SYCE3A1L190 88 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CPNE6O95741 557 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 KELP23276 732 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 MMP12P39900 470 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 LIG3P49916 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 POLE2P56282 527 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NOMO3P69849 1222 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 KCNAB2Q13303 367 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 GRM3Q14832 879 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 UGP2Q16851 508 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 RAB6CQ53S08 254 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 EFHC2Q5JST6 749 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 PIM3Q86V86 326 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NETO2Q8NC67 525 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 FGF22Q9HCT0 170 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.55□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TMEM202A6NGA9 273 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 INSIG1O15503 277 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 GP1BBP13224 206 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TYRO3Q06418 890 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NAA35Q5VZE5 725 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 STRADAQ7RTN6 431 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 RDH14Q9HBH5 336 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 LHX3Q9UBR4 397 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 SDK2Q58EX2 2172 aa14.54□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TNFRSF10CO14798 259 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 ZW10O43264 779 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CCL4P13236 92 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 PTPN9P43378 593 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 B4GALNT1Q00973 533 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 MAN2A1Q16706 1144 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 AMZ1Q400G9 498 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CCDC14Q49A88 953 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CCDC185Q8N715 623 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NKD1Q969G9 470 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NTAN1Q96AB6 310 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 TAAR9Q96RI9 348 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.53□□□□□ -0.08
SSR4-212ENST00000491833 CFAP69A5D8W1 941 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 RASA4BC9J798 803 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 RASA4O43374 803 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 TPM2P07951 284 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 MMEP08473 750 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 ELFN1P0C7U0 828 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 EPHB2P29323 1055 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 CASRP41180 1078 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 CCR10P46092 362 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 TPM4P67936 248 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 FOXK1P85037 733 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 SERINC3Q13530 473 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 PARP15Q460N3 678 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-212ENST00000491833 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms