RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 HARBI1Q96MB7 349 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL17Q9UF56 701 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 A6NNC1 897 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CHL1O00533 1208 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MDM4O15151 490 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA2P01563 188 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IL7RP16871 459 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 DCTDP32321 178 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NTRK2Q16620 822 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NOXA1Q86UR1 476 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 POC5Q8NA72 575 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM163Q8TC26 289 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF570Q96NI8 536 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TRMOQ9BU70 441 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 OGFRQ9NZT2 677 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 DNTTP04053 509 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CD58P19256 250 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IL11P20809 199 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LMAN1P49257 510 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GALCP54803 685 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LRMPQ12912 555 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GPSM1Q86YR5 675 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 WDR63Q8IWG1 891 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB2Q8N680 514 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MOAP1Q96BY2 351 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PDE7BQ9NP56 450 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FZD3Q9NPG1 666 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NENFQ9UMX5 172 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 RGS11O94810 467 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB4O95168 129 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SLPIP03973 132 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CBSLP0DN79 551 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ACTN1P12814 892 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNB2P17787 502 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CBSP35520 551 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PPP3CCP48454 512 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 CAMPP49913 170 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SORDQ00796 357 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 NAE1Q13564 534 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SGO1Q5FBB7 561 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 Q5PR19 223 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PDXDC1Q6P996 788 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 PALB2Q86YC2 1186 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 DECR2Q9NUI1 292 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 ATG13O75143 517 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-212ENST00000491302 DAB1O75553 588 aa7.88□□□□□ -1.15
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