RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NXNL1Q96CM4 212 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC39A13Q96H72 371 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A12Q96S37 553 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJA1P17302 382 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB8P26012 769 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARSDP51689 593 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSCQ1MX18 579 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNSTQ6PJW8 725 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMC7Q7Z402 723 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF38Q9H0F5 515 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLK2Q9NYY3 685 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN8P19075 237 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFR3P22607 806 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNCP24863 283 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC1A2P43004 574 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AQP4P55087 323 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BFSP2Q13515 415 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIMM44O43615 452 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX11BO96011 259 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGRP47804 291 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPGNQ6UW88 154 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA3CQ99985 751 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL22Q9GZX6 179 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYL1Q9Y2S2 319 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PATJQ8NI35 1801 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDLIM1O00151 329 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR39O43194 453 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLKB1P03952 638 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJA8P48165 433 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APLP1P51693 650 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBLBQ13191 982 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR17Q13304 367 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAB1Q13506 487 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO4Q32M45 955 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSCBQ5H9T9 825 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARC1Q5VT66 337 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXT2Q93063 718 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RCN3Q96D15 328 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPP4Q96JB8 637 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8orf48Q96LL4 319 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDRT15Q96T59 188 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL12RB2Q99665 862 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf21Q9H246 121 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL5AQ9Y689 179 aa15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPOP05164 745 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYNP07948 512 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFEBP19484 476 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3R1P27986 724 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF12Q96QT6 1004 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OXSMQ9NWU1 459 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.58■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAMP2O60895 175 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR6B1O95007 311 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL5P13501 91 aa15.58■□□□□ 0.08
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALK1P51570 392 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms