RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 CNNM3Q8NE01 707 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 NACC2Q96BF6 587 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 MVB12AQ96EY5 273 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 TLR10Q9BXR5 811 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 GPR88Q9GZN0 384 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ECT2Q9H8V3 914 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 CASS4Q9NQ75 786 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 OBP2AQ9NY56 170 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 YIPF1Q9Y548 306 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 HIVEP1P15822 2718 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 AKAP9Q99996 3911 aa4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SVILO95425 2214 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 A0A1B0GVT2 93 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 A1L4Q6 167 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 K7ENP7 123 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 DIAPH2O60879 1101 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 B3GAT3O94766 335 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ESRRBO95718 433 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 RXRAP19793 462 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ACTN2P35609 894 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 MAP2K6P52564 334 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SEC24CP53992 1094 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 TRAF1Q13077 416 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 LAYNQ6UX15 382 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ANO5Q75V66 913 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ELMOD1Q8N336 334 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 RNF149Q8NC42 400 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 STKLD1Q8NE28 680 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 TMIEQ8NEW7 156 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 Q96MF0 132 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SMOQ99835 787 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 TASP1Q9H6P5 420 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 INTS13Q9NVM9 706 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 NUMA1Q14980 2115 aa4.66□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.65□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.65□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 E7ENX8 843 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 FLRT2O43155 660 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 AKAP10O43572 662 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 HMMRO75330 724 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 THP07101 528 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 ZNF883P0CG24 379 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 DCTP40126 519 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 DPP6P42658 865 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 MATKP42679 507 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 TAP2Q03519 686 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 UPP1Q16831 310 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 GEN1Q17RS7 908 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 KIF19Q2TAC6 998 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 TXNDC8Q6A555 127 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 NOTUMQ6P988 496 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 Q6ZNX1 250 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.65□□□□□ -1.67
CNN3-206ENST00000487539 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms