RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 APC2O95996 2303 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PQ27 194 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PQ64 194 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PQC6 194 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 M0R3H8 397 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYO1FO00160 1098 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP26A1O43174 497 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FSBPO95073 299 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGR2O95994 175 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 RARGP13631 454 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC130P13994 396 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADORA2BP29275 332 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATICP31939 592 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNF1BP35680 557 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PGFP49763 221 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCT8P50990 548 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF132P52740 706 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF234Q14588 700 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 GEN1Q17RS7 908 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF699Q32M78 642 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 LAYNQ6UX15 382 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD163Q86VB7 1156 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PDILTQ8N807 584 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 GANCQ8TET4 914 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBATAQ96M53 351 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLIC6Q96NY7 704 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 LHX5Q9H2C1 402 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLIC4Q9Y696 253 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 POM121BA6NF01 834 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 E9PAM4 449 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 F8W8V4 182 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIMM44O43615 452 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 BEST1O76090 585 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEMA4FO95754 770 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 RALAP11233 206 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 P4HA1P13674 534 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLA2G2AP14555 144 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRKCHP24723 683 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACSL1P33121 698 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MFAP3P55082 362 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLDN6P56747 220 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP24A1Q07973 514 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FGL2Q14314 439 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSMD6Q15008 389 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD276Q5ZPR3 534 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 BICRALQ6AI39 1079 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TTC7BQ86TV6 843 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FUKQ8N0W3 1084 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 DDI1Q8WTU0 396 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGSF8Q969P0 613 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SKA1Q96BD8 255 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMX3Q96JJ7 454 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMOQ99835 787 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADI1Q9BV57 179 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 OSER1Q9NX31 292 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL37Q9NZH6 218 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms