RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 AP1S1P61966 158 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 AGERQ15109 404 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TCEA2Q15560 299 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ALG11Q2TAA5 492 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 BOLA3Q53S33 107 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PERM1Q5SV97 790 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 AFMIDQ63HM1 303 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 ZNF599Q96NL3 588 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 GPR34Q9UPC5 381 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GTH6 734 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 LRCH4O75427 683 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PCK1P35558 622 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TLE3Q04726 772 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ACOX1Q15067 660 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ARL14Q8N4G2 192 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 NPWQ8N729 165 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 HSPH1Q92598 858 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TRIM7Q9C029 511 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TMPRSS3P57727 454 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PSKH2Q96QS6 385 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 LRP4O75096 1905 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 A8MX80 341 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 KLK10O43240 276 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SERPINB6P35237 376 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 DPYSQ14117 519 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 DPYSL2Q16555 572 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 LIPIQ6XZB0 460 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 DPPA4Q7L190 304 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A7Q92504 469 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 DPH1Q9BZG8 443 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 STRADBQ9C0K7 418 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ISCUQ9H1K1 167 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TK2O00142 265 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 AMPD1P23109 780 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1024LP59773 190 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 RALGDSQ12967 914 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 KRT81Q14533 505 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 NR1I3Q14994 352 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 FIGNQ5HY92 759 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 KYQ8NBH2 561 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 HIC2Q96JB3 615 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.831e-12■□□□□ 10.2
ACTB-212ENST00000484841 WDR26Q9H7D7 661 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CPP00450 1065 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 NFKBIBQ15653 356 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 DENND2CQ68D51 928 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-212ENST00000484841 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.22■□□□□ 0.83
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