RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	EYA3	Q99504	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	LHPP	Q9H008	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765		A0A1B0GVT2	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CEP104	O60308	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CCKAR	P32238	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PGM1	P36871	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MLH1	P40692	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HNF4G	Q14541	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SHB	Q15464	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	RNF183	Q96D59	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CRB1	P82279	1406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CNTF	P26441	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	RYK	P34925	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MAPK9	P45984	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PMS2	P54278	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	DSC1	Q08554	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TRPC3	Q13507	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ASAP2	O43150	1006 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	POLB	P06746	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	NGFR	P08138	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	NAGA	P17050	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PTPN2	P17706	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MYF6	P23409	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	NUDT6	P53370	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	LPIN1	Q14693	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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