RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMM22Q9Y584 194 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPACA6W5XKT8 324 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMPD1P17405 629 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLD2P49005 469 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSEN1P49768 467 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RALGDSQ12967 914 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B3GALT6Q96L58 329 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.65■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KNL1Q8NG31 2342 aa16.64■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM38O00635 465 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMD7P51665 324 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPN2O95208 641 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPSB2P20231 275 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL1R2P27930 398 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXD13P35453 343 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRATP43155 626 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHN2P52757 468 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTA1Q13330 715 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGA7Q13683 1181 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCF4Q15080 339 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPSAB1Q15661 275 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSCO60682 206 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXN2P32314 431 aa16.64■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGFLR1Q9H665 355 aa16.64■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DTLQ9NZJ0 730 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLUHO75153 1309 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTA2O94776 668 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNH1O95259 989 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL18O95568 372 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLYCDO95822 493 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V1C1P21283 382 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIA1P42261 906 aa16.64■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.64■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPN8A6NHC0 703 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT75O95678 551 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGF1P05230 155 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HPGDP15428 266 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPD2P43304 727 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF460Q14592 562 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM187BQ17R55 369 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC157Q569K6 752 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BBS4Q96RK4 519 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DERAQ9Y315 318 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TULP2O00295 520 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT-ND1P03886 318 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP41Q3LFD5 358 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGAP2Q99490 1192 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REEP1Q9H902 201 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTT1P30711 240 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAC4Q86UU9 113 aa16.63■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPF3Q92784 378 aa16.63■□□□□ 0.25
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