RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 APOL2Q9BQE5 337 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN6O43657 245 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 FGF1P05230 155 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CNR2P34972 360 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 HNF1BP35680 557 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GRIA1P42261 906 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 EPHB1P54762 984 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PPP2CBP62714 309 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PPP2CAP67775 309 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SEMG2Q02383 582 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ELP6Q0PNE2 266 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ERAP2Q6P179 960 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 NEK5Q6P3R8 708 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ZNF534Q76KX8 674 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 RMDN1Q96DB5 314 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GPR174Q9BXC1 333 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 LRRC72A6NJI9 287 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 E7EVH7 732 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 H0Y858 1186 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 TP73O15350 636 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 TMEM63AO94886 807 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 IGHV4-34P06331 123 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 VIPR1P32241 457 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 FAM193AP78312 1265 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CDK16Q00536 496 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 TRIM69Q86WT6 500 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 PAF1Q8N7H5 531 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CASS4Q9NQ75 786 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 VPS13AQ96RL7 3174 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 A0A0U1RQS6 177 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 LATO43561 262 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 PIRTP0C851 137 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 GM2AP17900 193 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ADCY8P40145 1251 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CNGA3Q16281 694 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ZNF284Q2VY69 593 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CRTC1Q6UUV9 634 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 LIPIQ6XZB0 460 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 C11orf74Q86VG3 221 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 NDUFAF2Q8N183 169 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 LRRC45Q96CN5 670 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ERP44Q9BS26 406 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 LRRC1Q9BTT6 524 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PQU0 124 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 FAM47DPA6NHR8 397 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 A8MX80 341 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 NFKBIAP25963 317 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 RPL21P46778 160 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 CCR5P51681 352 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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ACTB-210ENST00000477812 FGL2Q14314 439 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 PLK5Q496M5 336 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 LRRC66Q68CR7 880 aa19.99■□□□□ 0.79
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ACTB-210ENST00000477812 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 C8orf74Q6P047 294 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 LINC00523Q86TU6 105 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 HORMAD1Q86X24 394 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 MCUQ8NE86 351 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 EID2BQ96D98 161 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 KCNH6Q9H252 994 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-210ENST00000477812 ZNF711Q9Y462 761 aa19.99■□□□□ 0.79
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