RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473832.1

DGCR2-204, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 2, human

TSL 5

Gene DGCR2, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR2-204	ENST00000473832	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CSF2	P04141	144 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	IL4R	P24394	825 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ABL2	P42684	1182 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	HCAR3	P49019	387 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	THOP1	P52888	689 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	COPS2	P61201	443 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68	1e-6	■■□□□ 12.3
DGCR2-204	ENST00000473832	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	FZD2	Q14332	565 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	KRT81	Q14533	505 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CYTH1	Q15438	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PARG	Q86W56	976 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	KCTD6	Q8NC69	237 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PBK	Q96KB5	322 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ZNF670	Q9BS34	389 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832		H3BRJ5	948 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	TOR1B	O14657	336 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CEP104	O60308	925 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PRAMEF11	O60813	436 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	MMP20	O60882	483 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CKMT1A	P12532	417 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	TIMP2	P16035	220 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PFN3	P60673	137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	YPEL5	P62699	121 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ELP6	Q0PNE2	266 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	DPYS	Q14117	519 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	HES3	Q5TGS1	186 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	RFX8	Q6ZV50	586 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PQLC3	Q8N755	202 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	NXPE2	Q96DL1	559 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	RNF157	Q96PX1	679 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ABCG4	Q9H172	646 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	USP29	Q9HBJ7	922 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	GPR27	Q9NS67	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ITM2B	Q9Y287	266 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	PLXNA2	O75051	1894 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	USP24	Q9UPU5	2620 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832		J3KR12	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832		K7ESM1	405 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	KRT10	P13645	584 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	JUND	P17535	347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ERCC2	P18074	760 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ARL4A	P40617	200 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	CSNK1D	P48730	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	LLGL1	Q15334	1064 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DGCR2-204	ENST00000473832	UGP2	Q16851	508 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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