RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PARP10Q53GL7 1025 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PCID2Q5JVF3 399 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 VSTM1Q6UX27 236 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCK2Q7Z695 626 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HACE1Q8IYU2 909 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CADM3Q8N126 398 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF276Q8N554 614 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX9Q8N6V9 391 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TERB1Q8NA31 727 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT8Q8NBV8 401 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8TCH9 128 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ASIC5Q9NY37 505 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LIPT1Q9Y234 373 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CXorf65A6NEN9 183 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM157AC9JC47 383 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 DNM1LO00429 736 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 OGG1O15527 345 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALNT1O75752 331 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TTLL1O95922 423 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL10O95999 233 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2D6P10635 497 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CTPS1P17812 591 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP20933 346 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EPHB2P29323 1055 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC14A1Q13336 389 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TCTN1Q2MV58 587 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CDONQ4KMG0 1287 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HS1BP3Q53T59 392 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ISM2Q6H9L7 571 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB12Q6IQ22 244 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CORO2AQ92828 525 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CDRT15Q96T59 188 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPB2A8KAH6 182 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KINO60870 393 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KERAO60938 352 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF623O75123 536 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CD63P08962 238 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ACRV1P26436 265 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRNA5P30532 468 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SHMT1P34896 483 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RYKP34925 604 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKCIP41743 596 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC12A2P55011 1212 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB4BP68371 445 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT3Q14435 633 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF273Q14593 569 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPB2Q16082 182 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SNAPC1Q16533 368 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MEP1BQ16820 701 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT24Q2M2I5 525 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 USP41Q3LFD5 358 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms