RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPY1Q01534 308 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 GHRHRQ02643 423 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXF2Q12947 444 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KLF10Q13118 480 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFAIP1Q13829 316 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PMS2CLQ68D20 193 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT16Q8N428 558 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KDM1BQ8NB78 822 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 AVL9Q8NBF6 648 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 BEST2Q8NFU1 509 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NELL1Q92832 810 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 EME1Q96AY2 570 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 APOL6Q9BWW8 343 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RABEP2Q9H5N1 569 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 THSD1Q9NS62 852 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LATS1O95835 1130 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKCGP05129 697 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP2P08253 660 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CTSAP10619 480 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 TFPIP10646 304 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CHATP28329 748 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCN3P51790 818 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ROR1Q01973 937 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM27E3Q08E93 113 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPSQ13938 189 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 NAB2Q15742 525 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 KYNUQ16719 465 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 DEF8Q6ZN54 512 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 TRILQ7L0X0 811 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LINGO2Q7L985 606 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 KBTBD6Q86V97 674 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB2Q8N680 514 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 BICD2Q8TD16 824 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD1Q96SE0 405 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LHPPQ9H008 270 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10A4Q9H209 315 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 HRH4Q9H3N8 390 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PADI1Q9ULC6 663 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0G2JK05 382 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 DAB1O75553 588 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 MTA2O94776 668 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CERS1P27544 350 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PTH2RP49190 550 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 STAT2P52630 851 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PNLIPRP2P54317 469 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ID2Q02363 134 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ITGADQ13349 1161 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 LPIN1Q14693 890 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF6Q15052 776 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-207ENST00000470201 CDONQ4KMG0 1287 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms