RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-205ENST00000468371 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.04□□□□□ -1.44
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SHQ1-205ENST00000468371 COL19A1Q14993 1142 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 DLG2Q15700 870 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CCNG2Q16589 344 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.03□□□□□ -1.44
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