RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3EA0A087X179 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 FAM187AA6NFU0 413 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 METTL12A8MUP2 240 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 E7EVH7 732 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 NEMP1O14524 444 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LATO43561 262 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 RHOBTB1O94844 696 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ZNF30P17039 623 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TPSB2P20231 275 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 VIPR1P32241 457 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 NUDT1P36639 197 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 FAM193AP78312 1265 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CDK16Q00536 496 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 RALGDSQ12967 914 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 GPS1Q13098 491 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 GALNT3Q14435 633 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TPSAB1Q15661 275 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PLK5Q496M5 336 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CEP68Q76N32 757 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 HORMAD1Q86X24 394 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 JAMLQ86YT9 394 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ASB12Q8WXK4 309 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 FICDQ9BVA6 458 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 L2HGDHQ9H9P8 463 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ITM2BQ9Y287 266 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.06■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CTAGE15A4D2H0 777 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PSMD11O00231 422 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PCDH8O95206 1070 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 AGTP01019 485 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ALPIP09923 528 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CTAGE8P0CG41 777 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 HNF1BP35680 557 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 AGERQ15109 404 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ELF2Q15723 593 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CTAGE6Q86UF2 777 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CTAGE4Q8IX94 777 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TRABDQ9H4I3 376 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 HACD3Q9P035 362 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 GGT7Q9UJ14 662 aa16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 MYLKQ15746 1914 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 A0A1W2PQU0 124 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 AP3B1O00203 1094 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TTI1O43156 1089 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PRKCGP05129 697 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 IGHV4-34P06331 123 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 APRTP07741 180 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ELFN1P0C7U0 828 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CTPS1P17812 591 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ITIH2P19823 946 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LHCGRP22888 699 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CHRNA4P43681 627 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LMAN1P49257 510 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 VPS41P49754 854 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PPP2CBP62714 309 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PPP2CAP67775 309 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 ARHGEF7Q14155 803 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 KCNJ11Q14654 390 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LIPIQ6XZB0 460 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 PCGF5Q86SE9 256 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 BIRC7Q96CA5 298 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 LOXL4Q96JB6 756 aa16.04■□□□□ 0.16
GPC1-207ENST00000466624 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms