RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFA10O95299 355 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 VAMP7P51809 220 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 GPR87Q9BY21 358 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 LHX9Q9NQ69 397 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 E2F3O00716 465 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 AREL1O15033 823 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TGFB1I1O43294 461 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 HLA-DRAP01903 254 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CCNB1P14635 433 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 KELP23276 732 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 RPS18P62269 152 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 RPS15P62841 145 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 RAPSNQ13702 412 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CARD16Q5EG05 197 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 HGSNATQ68CP4 663 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TTC7BQ86TV6 843 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 BIVMQ86UB2 503 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PSMB7Q99436 277 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 FGF22Q9HCT0 170 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TAAR2Q9P1P5 351 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM202A6NGA9 273 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 FANCGO15287 622 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM63AO94886 807 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PTPN4P29074 926 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 NDST2P52849 883 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PTK2Q05397 1052 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 IL10RAQ13651 578 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 MCTP1Q6DN14 999 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 RPTNQ6XPR3 784 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TTC39CQ8N584 583 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 TMC2Q8TDI7 906 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PATE1Q8WXA2 126 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 FOXC2Q99958 501 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CEP44Q9C0F1 390 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 DLL4Q9NR61 685 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL3Q9UH77 587 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 COQ6Q9Y2Z9 468 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 AKAP6Q13023 2319 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf3-211ENST00000463372 PIK3R2O00459 728 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 TNFRSF10CO14798 259 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 CLDN11O75508 207 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 PCCBP05166 539 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 RAD23BP54727 409 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 MTM1Q13496 603 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 PEX6Q13608 980 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 KYNUQ16719 465 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 FBXL22Q6P050 247 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 MTFR2Q6P444 385 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 TAC4Q86UU9 113 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 SKAP1Q86WV1 359 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 UBA3Q8TBC4 463 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT8Q8WV74 236 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 NCSTNQ92542 709 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 INPP5DQ92835 1189 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC120Q96HB5 630 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 SLC38A3Q99624 504 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 MXRA5Q9NR99 2828 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 RASA4BC9J798 803 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 RASA4O43374 803 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 ALPPP05187 535 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf3-211ENST00000463372 RHOCP08134 193 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms