RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	KEL	P23276	732 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NDUFS1	P28331	727 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CTGF	P29279	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MPG	P29372	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TYK2	P29597	1187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PTPN9	P43378	593 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DIO1	P49895	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SHC2	P98077	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SGCD	Q92629	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68	3e-6	■■□□□ 12.4
CNOT10-208	ENST00000463006	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HCRTR2	O43614	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AVIL	O75366	819 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A12	O75746	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FTCD	O95954	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HEXA	P06865	529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXB5	P09067	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PON1	P27169	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CDA	P32320	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	STAT6	P42226	847 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PDE1A	P54750	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SCN1B	Q07699	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	OLIG2	Q13516	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RUNX2	Q13950	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CNGA3	Q16281	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MCU	Q8NE86	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR78	Q96P69	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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