RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 LYSMD1Q96S90 227 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NAT9Q9BTE0 207 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 EPC1Q9H2F5 836 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB21Q9UL25 225 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CKAP5Q14008 2032 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC28Q96AY4 2481 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TECTAO75443 2155 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PP55 124 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 HEATR9A2RTY3 570 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf81A6NN90 581 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 E7ESA3 106 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NEMP1O14524 444 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PI15O43692 258 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 AP1G1O43747 822 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF217O75362 1048 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF30P17039 623 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TPH1P17752 444 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CTPS1P17812 591 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ADRA1DP25100 572 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MGAT1P26572 445 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ECHS1P30084 290 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 OXTRP30559 389 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 VIPR1P32241 457 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 DRD3P35462 400 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RY2P41231 377 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 VSNL1P62760 191 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM193AP78312 1265 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CNTN1Q12860 1018 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF7Q14155 803 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SLMAPQ14BN4 828 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP9Q49MG5 647 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PCID2Q5JVF3 399 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CASC4Q6P4E1 433 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 AADATQ8N5Z0 425 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 HHIPQ96QV1 700 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RANBP9Q96S59 729 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FZD4Q9ULV1 537 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 H0Y858 1186 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF10AO00220 468 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 AREL1O15033 823 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN6O43657 245 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 AVILO75366 819 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ERLIN1O75477 346 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC4O95801 387 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ALPIP09923 528 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXA6P31267 233 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 HNF1BP35680 557 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ABL2P42684 1182 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 METAP1P53582 386 aa9.42□□□□□ -0.9
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SH3BP4-208ENST00000462602 SEPT6Q14141 434 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 POU6F1Q14863 301 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 BRD3Q15059 726 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC38Q502W7 563 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 AGBL4Q5VU57 503 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 DENND2CQ68D51 928 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 ANO7Q6IWH7 933 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 EMBQ6PCB8 327 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 DPPA4Q7L190 304 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RASSF3Q86WH2 238 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC25Q86WR0 208 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 CACUL1Q86Y37 369 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RELL1Q8IUW5 271 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 STYXQ8WUJ0 223 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 PEX13Q92968 403 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-208ENST00000462602 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.42□□□□□ -0.9
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