RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM131	Q92545	1883 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GVT2	93 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241		A6NNZ2	444 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TLR4	O00206	839 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SLC31A1	O15431	190 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	OPHN1	O60890	802 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MMP2	P08253	660 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ELFN1	P0C7U0	828 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RBP3	P10745	1247 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF30	P17039	623 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	VIPR1	P32241	457 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CTSK	P43235	329 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FAM193A	P78312	1265 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SKOR1	P84550	965 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FGL2	Q14314	439 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	AADACL2	Q6P093	401 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LIPI	Q6XZB0	460 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CENPT	Q96BT3	561 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	IFT43	Q96FT9	208 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	AGAP3	Q96P47	875 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LYSMD1	Q96S90	227 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TLR10	Q9BXR5	811 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GPR27	Q9NS67	375 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GGT7	Q9UJ14	662 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0J9YYE9	177 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CAPN8	A6NHC0	703 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK3	O14649	394 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FPGT	O14772	594 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GDF9	O60383	454 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MMP20	O60882	483 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PRL	P01236	227 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	EPO	P01588	193 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TRBC1	P01850	177 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	WNT1	P04628	370 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	C6	P13671	934 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PRLR	P16471	622 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CD86	P42081	329 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RABIF	P47224	123 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	EPHB1	P54762	984 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NXPH1	P58417	271 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	YPEL5	P62699	121 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	BNC1	Q01954	994 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RALGDS	Q12967	914 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KIF19	Q2TAC6	998 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF567	Q8N184	647 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FCRL5	Q96RD9	977 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GDF3	Q9NR23	364 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LAMA1	P25391	3075 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	KIF5C	O60282	957 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA9	O76027	345 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PDHA1	P08559	390 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RBL1	P28749	1068 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LIG3	P49916	1009 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MPP3	Q13368	585 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	IHH	Q14623	411 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC14	Q15048	493 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-B	Q31612	363 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PID1	Q7Z2X4	250 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GBA3	Q9H227	469 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GAREM1	Q9H706	876 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	USP29	Q9HBJ7	922 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CHKB	Q9Y259	395 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf60	A6NFR6	353 aa		14.67	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms