RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 UBP1Q9NZI7 540 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 AURKCQ9UQB9 309 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DHRS12A0PJE2 317 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FUOMA2VDF0 154 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TREHO43280 583 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINB7O75635 380 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OCM2P0CE71 109 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 C7P10643 843 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TKTP29401 623 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ATP4BP51164 291 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PSMD7P51665 324 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TPI1P60174 286 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CTBP1Q13363 440 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GRB14Q14449 540 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PRPSAP1Q14558 356 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 INPP5AQ14642 412 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PKN3Q6P5Z2 889 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00523Q86TU6 105 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PIGZQ86VD9 579 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SNX31Q8N9S9 440 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SEPT8Q92599 483 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 WNT8BQ93098 351 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC126Q96EE4 140 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC45A3Q96JT2 553 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CD320Q9NPF0 282 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 INIPQ9NRY2 104 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TSC2P49815 1807 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA3BQ13214 749 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6AP1Q15904 470 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FGD3Q5JSP0 725 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ELMO2Q96JJ3 720 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TEKT5Q96M29 485 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf4Q9NR00 106 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NRCAMQ92823 1304 aa15□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HUS1O60921 280 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 UGT1A6P19224 532 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IL10P22301 178 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 UGT1A1P22309 533 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 UGT1A4P22310 534 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FASP25445 335 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ADRA1BP35368 520 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 UGT1A3P35503 534 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 UGT1A5P35504 534 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TAS2R39P59534 338 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0D1P61421 351 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BEX3Q00994 111 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SNX17Q15036 470 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MOGQ16653 247 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PCID2Q5JVF3 399 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC9A7Q96T83 725 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PALMDQ9NP74 551 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CPA4Q9UI42 421 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PSMD3O43242 534 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CD4P01730 458 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MYL3P08590 195 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CD247P20963 164 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TAF6P49848 677 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TKTL1P51854 596 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT2Q10471 571 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 XKR5Q6UX68 686 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MUC3BQ9H195 1237 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FAM149AA5PLN7 773 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 A8MT66 165 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PIRO00625 290 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NME4O00746 187 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CLOCKO15516 846 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RASAL1O95294 804 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HCAR3P49019 387 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFV1P49821 464 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BCAP31P51572 246 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms