RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425021.1

LINC00494-202, long intergenic non-protein coding RNA 494, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00494, Length 438 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00494-202ENST00000425021 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 KCNH6Q9H252 994 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CACNA1HO95180 2353 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 A0A1W2PPL8 197 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MROH6A6NGR9 719 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 KCNJ18B7U540 433 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 HHLA1C9JL84 531 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ZNF263O14978 683 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PRAMEF12O95522 483 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 OLFM2O95897 454 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 IL18BPO95998 194 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PLATP00750 562 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 VDRP11473 427 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 GLULP15104 373 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TYRP1P17643 537 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CTSSP25774 331 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ADORA2BP29275 332 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ECHS1P30084 290 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 GDI1P31150 447 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 VIPR2P41587 438 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CLCN5P51795 746 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ZNF132P52740 706 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 BCAT1P54687 386 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 SLC8A3P57103 927 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 STARD6P59095 220 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MYL5Q02045 173 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 LRMPQ12912 555 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TAF10Q12962 218 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 KCNJ12Q14500 433 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MIIPQ5JXC2 388 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TXNDC8Q6A555 127 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 YAF2Q8IY57 180 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 STPG3Q8N7X2 389 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 FBXO32Q969P5 355 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MSANTD3Q96H12 275 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 SYT3Q9BQG1 590 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 NDST4Q9H3R1 872 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 BRD9Q9H8M2 597 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CA14Q9ULX7 337 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 SCML2Q9UQR0 700 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 COL4A3Q01955 1670 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 C2orf78A6NCI8 922 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 O00370 1275 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 FRS3O43559 492 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PHF2O75151 1096 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CYP7B1O75881 506 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 TPM2P07951 284 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 HDCP19113 662 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 AOC1P19801 751 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ABCB4P21439 1286 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PON1P27169 355 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ADCY8P40145 1251 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MFAP3P55082 362 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PER3P56645 1201 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 SLC7A9P82251 487 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 CD69Q07108 199 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC00494-202ENST00000425021 ZNF77Q15935 545 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms