RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.58■□□□□ 0.57
USP25-204ENST00000400183 NEK5Q6P3R8 708 aa18.58■□□□□ 0.57
USP25-204ENST00000400183 PACS1Q6VY07 963 aa18.58■□□□□ 0.57
USP25-204ENST00000400183 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.58■□□□□ 0.57
USP25-204ENST00000400183 BRD9Q9H8M2 597 aa18.58■□□□□ 0.57
USP25-204ENST00000400183 EVA1BQ9NVM1 165 aa18.58■□□□□ 0.57
USP25-204ENST00000400183 SLC35G4P0C7Q5 338 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 HNF4AP41235 474 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 SP3Q02447 781 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ABRQ12979 859 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 GALNT3Q14435 633 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TNS4Q8IZW8 715 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 SFRP1Q8N474 314 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 MYDGFQ969H8 173 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PANX1Q96RD7 426 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 IDO1P14902 403 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TOMM20Q15388 145 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 FAM220AQ7Z4H9 259 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TRIM63Q969Q1 353 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 LINGO1Q96FE5 620 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 P2RY11Q96G91 374 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RACGAP1Q9H0H5 632 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 LHX5Q9H2C1 402 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 EHD3Q9NZN3 535 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 EPHA3P29320 983 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 NDUFA5Q16718 116 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TAPT1Q6NXT6 567 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 STRADAQ7RTN6 431 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 BTBD3Q9Y2F9 522 aa18.58■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PLSCR1O15162 318 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 NDUFS2O75306 463 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PRG2P13727 222 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 CTPS1P17812 591 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 UGCGQ16739 394 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TRMOQ9BU70 441 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.569e-7■■□□□ 11.5
USP25-204ENST00000400183 IGFBP4P22692 258 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RCVRNP35243 200 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 CLK3P49761 638 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RGS1Q08116 209 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 SCAIQ8N9R8 606 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ASZ1Q8WWH4 475 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 MSRAQ9UJ68 235 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 BMP7P18075 431 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ALG11Q2TAA5 492 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RCN3Q96D15 328 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PWWP2AQ96N64 755 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 GJB1P08034 283 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 MC4RP32245 332 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.57■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ISM1B1AKI9 464 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 GCATO75600 419 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ATP6AP2O75787 350 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 DMPKQ09013 629 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ENTPD5O75356 428 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 SERPINB7O75635 380 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ECDO95905 644 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TUSC3Q13454 348 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 MZT2BQ6NZ67 158 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 CLIP3Q96DZ5 547 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ITCHQ96J02 903 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RHOJQ9H4E5 214 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 DEPDC5O75140 1603 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 RFXANKO14593 260 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 ASGR1P07306 291 aa18.56■□□□□ 0.56
USP25-204ENST00000400183 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms