RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C21orf59P57076 290 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXK1P85037 733 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK18Q07002 472 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RALGDSQ12967 914 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNG2Q16589 344 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NETO1Q8TDF5 533 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCEAL3Q969E4 200 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYSMD1Q96S90 227 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDEM2Q9BV94 578 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMOC1Q9H4F8 434 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGT7Q9UJ14 662 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHKBQ9Y259 395 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMDP11532 3685 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0J9YYE9 177 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPN8A6NHC0 703 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP27XA6NNY8 438 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENC1O14682 589 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FPGTO14772 594 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DFNA5O60443 496 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBC1P01850 177 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGGP02679 453 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDHA1P08559 390 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELFN1P0C7U0 828 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6P13671 934 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRLRP16471 622 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITIH2P19823 946 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFKB1P19838 968 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIK2Q13002 908 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPP3Q13368 585 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGL2Q14314 439 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPSAP1Q14558 356 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IHHQ14623 411 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIPIQ6XZB0 460 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC45Q96CN5 670 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTP4Q96DX8 246 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFT43Q96FT9 208 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIB3Q96RU7 358 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX12Q9UMY4 172 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GVT2 93 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NNZ2 444 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLR4O00206 839 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCATO75600 419 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDST3O95803 873 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CER1O95813 267 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGAVP06756 1048 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GEMP55040 296 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF7Q14155 803 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P3H1Q32P28 736 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OXR1Q8N573 874 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPTQ96BT3 561 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDF3Q9NR23 364 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YKT6O15498 198 aa15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms