RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT8Q9NY28 637 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PAGE1O75459 146 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AOC1P19801 751 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TP53BP2Q13625 1128 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CRY1Q16526 586 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ARL15Q9NXU5 204 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CST1P01037 141 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 OR56A5P0C7T3 313 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PCNAP12004 261 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 L1CAMP32004 1257 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAM2Q99965 735 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT84Q9NSB2 600 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.44■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NPHS1O60500 1241 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 OTCP00480 354 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ANXA5P08758 320 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNCP24863 283 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GSSP48637 474 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA19Q7Z5L4 167 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MTERF3Q96E29 417 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GPC1P35052 558 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MPP1Q00013 466 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MOGSQ13724 837 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SATL1Q86VE3 508 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SEPT8Q92599 483 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 UROC1Q96N76 676 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 EPB42P16452 691 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GLUD2P49448 558 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GAD2Q05329 585 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 BCL2L1Q07817 233 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SYT12Q8IV01 421 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TEKT5Q96M29 485 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FZD10Q9ULW2 581 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PIRTP0C851 137 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NOVP48745 357 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GALK1P51570 392 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 BEX3Q00994 111 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FSTL1Q12841 308 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM210AQ96ND0 272 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 IPPQ9Y573 584 aa16.43■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 LRG1P02750 347 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HTR7P34969 479 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DLG2Q15700 870 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF605Q86T29 641 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MPP5Q8N3R9 675 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AZIN2Q96A70 460 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 OSBPL6Q9BZF3 934 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 LRIG2O94898 1065 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKCHP24723 683 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AMER2Q8N7J2 671 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CAMKK2Q96RR4 588 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ALOX12P18054 663 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NMBRP28336 390 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ACAP2Q15057 778 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 REP15Q6BDI9 236 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC51AQ86UW1 340 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 S100ZQ8WXG8 99 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AGAP2Q99490 1192 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 LRP6O75581 1613 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 GPIP06744 558 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CBR4Q8N4T8 237 aa16.42■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TADA1Q96BN2 335 aa16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms