RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 NTSR1P30989 418 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEPT6Q14141 434 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 POM121L1PQ3SYA9 428 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF852Q6ZMS4 543 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRIG1Q96JA1 1093 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPO11Q9Y5K1 396 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC78A2IDD5 438 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPAG6O75602 509 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIA4P48058 902 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC5AQ6ZN44 842 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF778Q96MU6 729 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL21Q9UKT6 434 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPM1HQ9ULR3 514 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOX13Q9UN79 622 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRBA1A5PL33 1030 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAM23O75077 832 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALPIP09923 528 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGAM1P18669 254 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL26P61254 145 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKCQQ04759 706 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDE2Q6IQ49 451 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIFC1Q9BW19 673 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACSS3Q9H6R3 686 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 WNT16Q9UBV4 365 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCAF1Q9Y4C2 921 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEB16A2A368 324 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH16O75309 829 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRNPP04156 253 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 NR1D1P20393 614 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADRA1DP25100 572 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCAP28676 217 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABL2P42684 1182 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO43Q4G163 708 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKN3Q6P5Z2 889 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 GABRG3Q99928 467 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAT9Q9BTE0 207 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CKAP5Q14008 2032 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0J9YYE9 177 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRBC1P01850 177 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 METAP1P53582 386 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF805Q5CZA5 627 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNJLQ8IV13 435 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMIEQ8NEW7 156 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 MDGA1Q8NFP4 955 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 BRSK1Q8TDC3 778 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD3Q96ES6 412 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 RANBP9Q96S59 729 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 LGALS13Q9UHV8 139 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHTF1Q9UMS5 762 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIOO75962 3097 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0U1RQS6 177 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 HEATR9A2RTY3 570 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 AURKAO14965 403 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL1BP01584 269 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 NMBRP28336 390 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 HPDP32754 393 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL38Q2WGJ6 581 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC73Q5JTD7 316 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA1211LQ6NV74 962 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 BRAT1Q6PJG6 821 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM135Q86UB9 458 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPCSQ9HAB8 311 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD320Q9NPF0 282 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.051e-6■■■■■ 30
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCTD3Q9Y597 815 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL5AQ9Y689 179 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 VCANP13611 3396 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLBP06746 335 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTA2P09210 222 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRYMQ14894 314 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.042e-15■■■□□ 15.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDRPQ86YL5 185 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPOCK2Q92563 424 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 EURLQ9NYK6 297 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBK1Q9UHD2 729 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PQ67 120 aa27.81■■■□□ 2.04
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