RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 HMCESQ96FZ2 354 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 MARK4Q96L34 752 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR78Q96P69 363 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM38O00635 465 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 EFEMP1Q12805 493 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT6Q14141 434 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA6LQ8N4H0 392 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-201ENST00000369862 SOAT2O75908 522 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ASLP04424 464 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 MAXP61244 160 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PTK2BQ14289 1009 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 IHHQ14623 411 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMD5Q16401 504 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF470Q6ECI4 717 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP70Q8NHQ1 597 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 DDI1Q8WTU0 396 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ASB9Q96DX5 294 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 B3GALT6Q96L58 329 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 NPAS2Q99743 824 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 APPL1Q9UKG1 709 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 AURKAO14965 403 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 STMN1P16949 149 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMD8P48556 350 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC10A7Q0GE19 358 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 APOFQ13790 326 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TSTD2Q5T7W7 516 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF180Q86T96 592 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 NT5MQ9NPB1 228 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 MRGBPQ9NV56 204 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 FNIP2Q9P278 1114 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PADI4Q9UM07 663 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 DMTF1Q9Y222 760 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SDHDO14521 159 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC2A3P11169 496 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKL1Q00532 357 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 GK3PQ14409 553 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SPNS2Q8IVW8 549 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 NXNL1Q96CM4 212 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIP2Q9C0E4 1043 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TMCO1Q9UM00 188 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 RHOQP17081 205 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 NDST2P52849 883 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS2R39P59534 338 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PELI3Q8N2H9 469 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 IGSF8Q969P0 613 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 OCEL1Q9H607 264 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM248Q9NWD8 314 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 IL37Q9NZH6 218 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 H0YJX3 145 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V1B1P15313 513 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 CD86P42081 329 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM259Q4ZIN3 620 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 TOP1MTQ969P6 601 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-201ENST00000369862 ARNT2Q9HBZ2 717 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms