RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 EPHX1P07099 455 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GRIA4P48058 902 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GPS2Q13227 327 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CHPFQ8IZ52 775 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 OR13C4Q8NGS5 318 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TMEM109Q9BVC6 243 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MOCS1Q9NZB8 636 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FAM50BQ9Y247 325 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 STON1Q9Y6Q2 735 aa17.86■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ALDH1A2O94788 518 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 METAP1P53582 386 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MGAT5Q09328 741 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 C2orf27AQ580R0 203 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 C9orf64Q5T6V5 341 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FSTL4Q6MZW2 842 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KCNMB4Q86W47 210 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CACUL1Q86Y37 369 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PLPP6Q8IY26 295 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 BRSK1Q8TDC3 778 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TRPV5Q9NQA5 729 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TREX1Q9NSU2 369 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ZNF711Q9Y462 761 aa17.85■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MROH6A6NGR9 719 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 MSH2P43246 934 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ARSDP51689 593 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TDGQ13569 410 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KDM1BQ8NB78 822 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 OR8D1Q8WZ84 308 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ECHDC3Q96DC8 303 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 VPS18Q9P253 973 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GGT7Q9UJ14 662 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SARDHQ9UL12 918 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 A0A0J9YYE9 177 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 OR51F1A6NGY5 319 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 LOC730098B7Z3J9 87 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TCEA3O75764 348 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CRTAMO95727 393 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TRBC1P01850 177 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CD72P21854 359 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ARNTP27540 789 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 OAS2P29728 719 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 HNF1BP35680 557 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RPL26P61254 145 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GRM3Q14832 879 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CYP4X1Q8N118 509 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 TTC30BQ8N4P2 665 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 OR13J1Q8NGT2 312 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 DCAKDQ8WVC6 231 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 AGAP2Q99490 1192 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 GPR63Q9BZJ6 419 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 BPIFA1Q9NP55 256 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 ZFATQ9P243 1243 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 PSAT1Q9Y617 370 aa17.84■□□□□ 0.45
LTV1-201ENST00000367576 CAPN8A6NHC0 703 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 PLK4O00444 970 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 RNF40O75150 1001 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 INHBAP08476 426 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 SRFP11831 508 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 PAMP19021 973 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF4P43489 277 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 TPRG1Q6ZUI0 275 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 TSPAN33Q86UF1 283 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 LRRC6Q86X45 466 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 OR4K2Q8NGD2 314 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 SLC44A1Q8WWI5 657 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 CDKL2Q92772 493 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 HDAC10Q969S8 669 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 MED4Q9NPJ6 270 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 PRSS16Q9NQE7 514 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 IKBKGQ9Y6K9 419 aa17.83■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
LTV1-201ENST00000367576 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms