RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361311.4

CLSTN1-201, Transcript of calsyntenin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN1, Length 4,647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1-201ENST00000361311 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MATKP42679 507 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MTHFRP42898 656 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 COPZ1P61923 177 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TLK2Q86UE8 772 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 AQP12BA6NM10 295 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 CYP4B1P13584 511 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 DPEP1P16444 411 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC26A3P40879 764 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 UNC93AQ86WB7 457 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 LZTR1Q8N653 840 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 PPM1MQ96MI6 270 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 DYRK4Q9NR20 520 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 NENFQ9UMX5 172 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 VWA7Q9Y334 891 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 AP2A1O95782 977 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 NCK1P16333 377 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 HALP42357 657 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MPP1Q00013 466 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF567Q8N184 647 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ACTR8Q9H981 624 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 B4GALT5O43286 388 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TGFB3P10600 412 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 INSRRP14616 1297 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 CNTN2Q02246 1040 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 PRKCQQ04759 706 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 CA9Q16790 459 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 HOMEZQ8IX15 550 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 DNERQ8NFT8 737 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 FAR1Q8WVX9 515 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ELMO1Q92556 727 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TPD52L3Q96J77 140 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MUC13Q9H3R2 512 aa16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MYH1P12882 1939 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MYH4Q9Y623 1939 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 NDUFS2O75306 463 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 PDE9AO76083 593 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ANGPTL1O95841 491 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ARHGEF6Q15052 776 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 NCF4Q15080 339 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 BIRC8Q96P09 236 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 KCNK13Q9HB14 408 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 B4GALT4O60513 344 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ETV4P43268 484 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF423Q2M1K9 1284 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 TOP1MTQ969P6 601 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 CITED4Q96RK1 184 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 DTLQ9NZJ0 730 aa16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CLSTN1-201ENST00000361311 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 CLPXO76031 633 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 FTH1P02794 183 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 MAPK1P28482 360 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 PWP1Q13610 501 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 KBTBD6Q86V97 674 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 OR2T12Q8NG77 320 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 HAPLN3Q96S86 360 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 COL20A1Q9P218 1284 aa16.02■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 K7EPI3 171 aa16.01■□□□□ 0.15
CLSTN1-201ENST00000361311 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms