RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CEP68Q76N32 757 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 HORMAD1Q86X24 394 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL7Q8IXQ5 586 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FOXJ1Q92949 421 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC45Q96CN5 670 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FSD1LQ9BXM9 530 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 GGT7Q9UJ14 662 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ITM2BQ9Y287 266 aa13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CACNA1EQ15878 2313 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 NEMP1O14524 444 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RHOBTB1O94844 696 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SUN1O94901 812 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PCDH8O95206 1070 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCGP05129 697 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FGF1P05230 155 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4-34P06331 123 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 VIPR1P32241 457 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 NUDT1P36639 197 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEA6P43360 314 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FAM193AP78312 1265 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PTK6Q13882 451 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 GALNT3Q14435 633 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SLC1A5Q15758 541 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC70Q6NSX1 233 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TMEFF1Q8IYR6 380 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ASB12Q8WXK4 309 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 BIRC7Q96CA5 298 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RMDN1Q96DB5 314 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FICDQ9BVA6 458 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQU0 124 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PSMD11O00231 422 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 AGTP01019 485 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ALPIP09923 528 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF30P17039 623 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CTPS1P17812 591 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 LHCGRP22888 699 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 HNF1BP35680 557 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CHRNA4P43681 627 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 DR1Q01658 176 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf54Q08AI8 447 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 GPS1Q13098 491 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R7Q15435 360 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 LIPIQ6XZB0 460 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 JAMLQ86YT9 394 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 DNASE2BQ8WZ79 361 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 LOXL4Q96JB6 756 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 HSPA12BQ96MM6 686 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM14Q96QK8 99 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 KRT12Q99456 494 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 ORAI3Q9BRQ5 295 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.28□□□□□ -0.28
CCDC42-201ENST00000293845 PRR23AA6NEV1 266 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 E7EVH7 732 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 FSBPO95073 299 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 TPSB2P20231 275 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PTGER3P43115 390 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 VPS41P49754 854 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CDK16Q00536 496 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CREB5Q02930 508 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 OLIG2Q13516 323 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 KCNJ11Q14654 390 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 AGERQ15109 404 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 TPSAB1Q15661 275 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms