RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 TK2O00142 265 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MFSD11O43934 449 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ELP6Q0PNE2 266 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MBOAT7Q96N66 472 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RHOJQ9H4E5 214 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PBX1P40424 430 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C22orf31O95567 290 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TALDO1P37837 337 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TTMPQ5BVD1 217 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MARK4Q96L34 752 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ATP6V1G2O95670 118 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CXCR3P49682 368 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TNS4Q8IZW8 715 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SVOPQ8N4V2 548 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FBXO30Q8TB52 745 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RNFT2Q96EX2 444 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CERS4Q9HA82 394 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 AZIN1O14977 448 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BIRC5O15392 142 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 NDST3O95803 873 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PTPN2P17706 415 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PTPN9P43378 593 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GBE1Q04446 702 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KLHL35Q6PF15 583 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 IFNL1Q8IU54 200 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PTPRJQ12913 1337 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 EPHX1P07099 455 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ZNF276Q8N554 614 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ADI1Q9BV57 179 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 A0A1B0GVM2 712 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GABRB2P47870 512 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PDK4Q16654 411 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DLG3Q92796 817 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PRNPP04156 253 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PLD5Q8N7P1 536 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TCF25Q9BQ70 676 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 FZD9O00144 591 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ACLYP53396 1101 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PRKG2Q13237 762 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MAP10Q9P2G4 905 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KLHL3Q9UH77 587 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 STBD1O95210 358 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MYL12AP19105 171 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 WASP42768 502 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CDH4P55283 916 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 HIC2Q96JB3 615 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 CDK14O94921 469 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TPSB2P20231 275 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 TPSAB1Q15661 275 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GPR180Q86V85 440 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 KRT75O95678 551 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 GNA12Q03113 381 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 COMMD2Q86X83 199 aa20.29■□□□□ 0.84
USP25-202ENST00000285681 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms