RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 CBLBQ13191 982 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 RASA2Q15283 850 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 PITRM1Q5JRX3 1037 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 C12orf40Q86WS4 652 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 IRF7Q92985 503 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 TADA1Q96BN2 335 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SGF29Q96ES7 293 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CPNE1Q99829 537 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SH3GL3Q99963 347 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 EMCNQ9ULC0 261 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 PLLPQ9Y342 182 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 A0A096LPK6 155 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 HEATR9A2RTY3 570 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 KITP10721 976 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ETV4P43268 484 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SERPINB4P48594 390 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 EPHA5P54756 1037 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 EPHB1P54762 984 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 GEN1Q17RS7 908 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 PIM3Q86V86 326 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 MAGEB18Q96M61 343 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CIPCQ9C0C6 399 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 PPCSQ9HAB8 311 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 MUC3AQ02505 3323 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.03□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 NDST3O95803 873 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 C2P06681 752 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 LIMK2P53671 638 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZVU0 165 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 CHST14Q8NCH0 376 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 FGF13Q92913 245 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 EID2BQ96D98 161 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF599Q96NL3 588 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 SPHK2Q9NRA0 654 aa11.02□□□□□ -0.64
GGPS1-201ENST00000282841 ZWINTO95229 277 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 GLP2RO95838 553 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 SERPINB9P50453 376 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF77Q15935 545 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 GRTP1Q5TC63 336 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 FIBINQ8TAL6 211 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 FEM1CQ96JP0 617 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 OMDQ99983 421 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 MROH6A6NGR9 719 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 EBAG9O00559 213 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 SRCP12931 536 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 SLC6A11P48066 632 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R39P59534 338 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 GRM2Q14416 872 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 CHI3L2Q15782 390 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 NCEH1Q6PIU2 408 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 ATG14Q6ZNE5 492 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 CYS1Q717R9 158 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 AGR3Q8TD06 166 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 OLFM1Q99784 485 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.02□□□□□ -0.65
GGPS1-201ENST00000282841 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms