RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RANBP1P43487 201 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A3P53794 718 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FOXM1Q08050 763 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF276Q8N554 614 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CCDC189A1A4V9 331 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 OR6C75A6NL08 312 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SPTLC1O15269 473 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RHOCP08134 193 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GLDCP23378 1020 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HOXD10P28358 340 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PBX3P40426 434 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF6Q15052 776 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SFT2D3Q587I9 215 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 IFNEQ86WN2 208 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LPPQ93052 612 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HDAC10Q969S8 669 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FAM162AQ96A26 154 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 USP3Q9Y6I4 520 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DHRS12A0PJE2 317 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 AQP12BA6NM10 295 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NRP1O14786 923 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CLOCKO15516 846 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TTPAP49638 278 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 THOP1P52888 689 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RNF180Q86T96 592 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HASPINQ8TF76 798 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LPGAT1Q92604 370 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZFP42Q96MM3 310 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ADAM2Q99965 735 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RNF39Q9H2S5 420 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RMND5AQ9H871 391 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQH9 124 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 H3BMM5 538 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HCRTO43612 131 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GPIP06744 558 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GRIA3P42263 894 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MAGEA12P43365 314 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SERPINB10P48595 397 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 BTKQ06187 659 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MIB1Q86YT6 1006 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LEMD2Q8NC56 503 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HM13Q8TCT9 377 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PEX13Q92968 403 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FEM1CQ96JP0 617 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 C1orf74Q96LT6 269 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HGH1Q9BTY7 390 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YYE9 177 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RAD51BO15315 384 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MYO1DO94832 1006 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PGM3O95394 542 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms