RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ERAP2Q6P179 960 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 LIPIQ6XZB0 460 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 IQCHQ86VS3 1027 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SCRN2Q96FV2 425 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 GLOD4Q9HC38 313 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 GPR27Q9NS67 375 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CHKBQ9Y259 395 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CFAP69A5D8W1 941 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 A8MX80 341 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TM7SF2O76062 418 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CPP00450 1065 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 C6P13671 934 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 AKT2P31751 481 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CETN2P41208 172 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SGCGQ13326 291 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 AGERQ15109 404 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KA1Q15418 735 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF567Q8N184 647 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.182e-7■□□□□ 8.2
SYF2-201ENST00000236273 GAREM1Q9H706 876 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 USP29Q9HBJ7 922 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 A0A0U1RQS6 177 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 H7C0C1 242 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 NEBLO76041 1014 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 RBP3P10745 1247 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 LHCGRP22888 699 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ATP5OP48047 213 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 OVGP1Q12889 678 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SHBQ15464 509 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TRIM58Q8NG06 486 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 OR13H1Q8NG92 308 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TRIB3Q96RU7 358 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 MTSS1O43312 755 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ALPIP09923 528 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CD59P13987 128 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CTPS1P17812 591 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ID4P47928 161 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 C21orf59P57076 290 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CCDC181Q5TID7 509 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 VAT1Q99536 393 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 RTKNQ9BST9 563 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YYE9 177 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TRBC1P01850 177 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 THEGLP0DJG4 465 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 VIPR1P32241 457 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 HNF1BP35680 557 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 IGFALSP35858 605 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PFN3P60673 137 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CNGA3Q16281 694 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZSR6 202 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 COQ10AQ96MF6 247 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CARD9Q9H257 536 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 OPHN1O60890 802 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 ZNF883P0CG24 379 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 NFKB1P19838 968 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SDHBP21912 280 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 SLC14A2Q15849 920 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CDKN3Q16667 212 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 QPCTQ16769 361 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-201ENST00000236273 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.1 ms