RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ARHGEF15O94989 841 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 UBE3AQ05086 875 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CACNG1Q06432 222 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DPYSQ14117 519 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 HERC3Q15034 1050 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 BTBD9Q96Q07 612 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GLOD4Q9HC38 313 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MSRAQ9UJ68 235 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ILVBLA1L0T0 632 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 HIPK3Q9H422 1215 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 INVSQ9Y283 1065 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 A0A087WXM4 84 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 WDR27A2RRH5 827 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PIRO00625 290 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 UROSP10746 265 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CYP51A1Q16850 503 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FUT10Q6P4F1 479 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 INSL6Q9Y581 213 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 H0Y3Z8 333 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SMIM22K7EJ46 135 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CCDC166P0CW27 439 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 YY1P25490 414 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZNF132P52740 706 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ITCHQ96J02 903 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.36□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 STX11O75558 287 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 IL1RL1Q01638 556 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SCAPQ12770 1279 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CSHL1Q14406 222 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DDR2Q16832 855 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 HAO1Q9UJM8 370 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 INSIG1O15503 277 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 UPP2O95045 317 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SLC5A3P53794 718 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GNA12Q03113 381 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GLMNQ92990 594 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SPATA17Q96L03 361 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SPASTQ9UBP0 616 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RIPK3Q9Y572 518 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PAGE1O75459 146 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GLUD1P00367 558 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LDLRP01130 860 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ETS1P14921 441 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PSMB4P28070 264 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PIK3CBP42338 1070 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TRIM17Q9Y577 477 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PSME4Q14997 1843 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KRT34O76011 436 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CAPZA2P47755 286 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 STRA6Q9BX79 667 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZNF711Q9Y462 761 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 E9PAM4 449 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 STON2Q8WXE9 905 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RAB7BQ96AH8 199 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C19orf60Q96EN9 201 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SNX15Q9NRS6 342 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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