RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 CDH23Q9H251 3354 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 GLP2RO95838 553 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CPA3P15088 417 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 STX3Q13277 289 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 DBN1Q16643 649 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 FITM2Q8N6M3 262 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 OR6K2Q8NGY2 324 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ING5Q8WYH8 240 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 C7orf26Q96N11 449 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 OMDQ99983 421 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CERS4Q9HA82 394 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 NMRAL1Q9HBL8 299 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ACOT9Q9Y305 439 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 MYO1CO00159 1063 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 DNAJC6O75061 913 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ABL2P42684 1182 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 SLC12A2P55011 1212 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 OCRLQ01968 901 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 PTPRRQ15256 657 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 EFHBQ8N7U6 833 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 LEMD2Q8NC56 503 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 A0A0G2JND7 137 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 TGDSO95455 350 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 S1PR4O95977 384 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CRABP2P29373 138 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 POU4F1Q01851 419 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 TRANK1O15050 2925 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 C2orf81A6NN90 581 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 UBOX5O94941 541 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 HLA-FP30511 346 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 GLRBP48167 497 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 LIG3P49916 1009 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CLCN5P51795 746 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CEBPBP17676 345 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 AP1S1P61966 158 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 SHHQ15465 462 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 GALNT7Q86SF2 657 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 OR4L1Q8NH43 312 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 LMLNQ96KR4 655 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 OLFM1Q99784 485 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 CATSPERZQ9NTU4 200 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTG-201ENST00000204679 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 G3V2L1 256 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 SEMA3AQ14563 771 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 MRNIPQ6NTE8 343 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 CAMK1DQ8IU85 385 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF398Q8TD17 642 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 SCYL1Q96KG9 808 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 BBS2Q9BXC9 721 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 ZMYND15Q9H091 742 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 TNKS2Q9H2K2 1166 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 THAP1Q9NVV9 213 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 A0A0U1RQS6 177 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 ITM2AO43736 263 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 RALBP11234 206 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 COL6A2P12110 1019 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 PLK1P53350 603 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 EPHB1P54762 984 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 ITGA9Q13797 1035 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF77Q15935 545 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTG-201ENST00000204679 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms