RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CtbsQ8R242 366 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm2832F7AEC7 200 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm14496K7N5U4 849 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1022L7MTT3 315 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr743L7N1Y2 311 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Epb41P48193 858 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AtminQ6P9S1 818 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1198Q7TR12 308 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cept1Q8BGS7 416 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clic5Q8BXK9 251 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ipo13Q8K0C1 963 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TraipQ8VIG6 470 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Golm1Q91XA2 393 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dbn1Q9QXS6 706 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Psmd13Q9WVJ2 376 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr81Q5ND34 1934 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa22.68■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nup205A0A0J9YUD5 2061 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp4a12bA2A974 508 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zmynd12A2BGJ5 363 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm6133B2RY53 190 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3252E9PUT9 216 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3002E9PW72 216 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp780bE9Q2S6 806 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3468E9QAJ8 216 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CcnoP0C242 352 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PrkcgP63318 697 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adra1dP97714 562 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cpne7Q0VE82 557 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp607aQ3TQG9 686 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tlr12Q6QNU9 906 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smpd4Q6ZPR5 823 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RubcnQ80U62 956 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fads6Q80UG1 342 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TdrkhQ80VL1 560 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pex19Q8VCI5 299 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ak5Q920P5 562 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trmt11Q9CWH5 460 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MkksQ9JI70 570 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd320Q9Z1P5 260 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf106O88466 1888 aa22.67■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnt2D3Z649 1135 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp758E9QAA1 583 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spp1P10923 294 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Psmd3P14685 530 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cxcl9P18340 126 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gucy2eP52785 1108 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fzd6Q61089 709 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FcrlaQ920A9 352 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q922M7 232 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc40Q9CRC8 602 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hormad1Q9D5T7 392 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf518bB2RRE4 1077 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Top3aO70157 1003 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt4P07744 525 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Npr1P18293 1057 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdh5P55284 784 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sap25Q1EHW4 186 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim67Q505D9 768 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 UrgcpQ5NCI0 926 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr463Q5SW49 311 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr462Q5SW50 311 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx4Q61496 702 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Casc4Q6P2L7 435 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mon1aQ6PDG8 556 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dpp9Q8BVG4 862 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpr21Q8BX79 349 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc34Q8C0Q3 554 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc66Q8K0B3 872 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SgshQ9EQ08 502 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arid3bQ9Z1N7 568 aa22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ighg3A0A1Y7VJN6 399 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf19bA2A7Q9 732 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zscan5bB2RTN3 468 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd4P06332 457 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtf2Q02395 593 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tead4Q62296 427 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clec18aQ7TSQ1 534 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trit1Q80UN9 467 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pramel7Q810Y8 479 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 March2Q99M02 246 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rfc5Q9D0F6 339 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wfdc1Q9ESH5 211 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cldn3Q9Z0G9 219 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BhmtO35490 407 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnc1P15388 511 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Impdh1P50096 514 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.2 ms