RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CtsjQ9R014 334 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dopey1Q8BL99 2399 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AF366264G3X9P9 502 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r19G5E8G4 854 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TtlP38585 377 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sult2a2P50236 285 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mc4rP56450 332 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnn2P58390 839 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mylk3Q3UIZ8 795 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nuak1Q641K5 658 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stx3Q64704 289 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zdhhc19Q810M5 347 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Orai2Q8BH10 250 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm5591Q8CDK1 855 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Irak3Q8K4B2 609 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc8a2Q8K596 921 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CarfQ8VHI4 689 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atpaf2Q91YY4 289 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9CPS8 106 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9D937 123 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Armc8Q9DBR3 673 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bmp10Q9R229 421 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc22a4Q9Z306 553 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Armt1A6H630 439 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sema6aO35464 1031 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MatkP41242 505 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hnf4aP49698 474 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Btbd1P58544 488 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc26a1P58735 704 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rmdn3Q3UJU9 470 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab26Q504M8 260 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lcn3Q62471 182 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lemd2Q6DVA0 511 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt73Q6NXH9 539 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf473Q8BI67 892 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam151aQ8QZW3 608 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zdhhc3Q8R173 299 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc15a4Q91W98 574 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdha2Q91Y17 948 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nek8Q91ZR4 698 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cul2Q9D4H8 745 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mzb1Q9D8I1 188 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc13a2Q9ES88 586 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trpc4apQ9JLV2 797 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Apobec2Q9WV35 224 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r17E9PYF5 849 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 2610028H24RikG5E8K1 270 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdh3P10287 822 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 S100a9P31725 113 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DsppP97399 934 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bop1P97452 732 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atf4Q06507 349 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rbl1Q64701 1063 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SybuQ8BHS8 665 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Syn3Q8JZP2 579 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PhykplQ8R1K4 467 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trmt10bQ9D075 318 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tssk3Q9D2E1 268 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dgcr8Q9EQM6 773 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxo17Q9QZM8 286 aa9□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Osbpl7A2A716 963 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3752A6NAT4 150 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Skint6A7XUZ6 1240 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pnldc1B2RXZ1 531 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm4847G3X946 537 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kifc3O35231 824 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2b19O55071 492 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fzd1O70421 642 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccnb1P24860 430 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sat1P48026 171 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igsf9Q05BQ1 1179 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prmt9Q3U3W5 846 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Syce1lQ5D525 247 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PighQ5M9N4 188 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Six2Q62232 296 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atg9bQ6EBV9 922 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Frmd5Q6P5H6 517 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim14Q8BVW3 440 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp566Q8VCI1 386 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2c70Q91W64 489 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dlgap1Q9D415 992 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp12Q9D9M2 370 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dpysl5Q9EQF6 564 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Capn7Q9R1S8 813 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ClcnkbQ9WUB6 687 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl32A2AJX0 620 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc43a3A2AVZ9 502 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp94E9Q6Y4 486 aa8.99□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gh1P06880 216 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms