RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PHC3Q8NDX5 983 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NTAN1Q96AB6 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C7orf26Q96N11 449 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HAPLN3Q96S86 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C8orf4Q9NR00 106 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF536O15090 1300 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TLL1O43897 1013 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RASSF9O75901 435 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CBX6O95503 412 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 COL6A1P12109 1028 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PRDX6P30041 224 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DAOAP59103 153 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 XIAPP98170 497 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IL10RBQ08334 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GRB14Q14449 540 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IRGCQ6NXR0 463 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PCED1BQ96HM7 432 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MUC13Q9H3R2 512 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 URADA6NGE7 173 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ACSL4O60488 711 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ATG7O95352 703 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PROCP04070 461 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HPGDP15428 266 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OR1D2P34982 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FLT3P36888 993 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH9A1P49189 494 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TCEAL1Q15170 157 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TCEA2Q15560 299 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRNQ16849 979 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FUT10Q6P4F1 479 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MICU2Q8IYU8 434 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BBS2Q9BXC9 721 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BCO2Q9BYV7 579 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ARMCX1Q9P291 453 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 AZIN1O14977 448 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 INPP4BO15327 924 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NDST3O95803 873 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GABRR2P28476 465 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HCAR3P49019 387 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IRF8Q02556 426 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DPYSL2Q16555 572 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KLQ9UEF7 1012 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 VPS4AQ9UN37 437 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM20BO75063 409 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KRT75O95678 551 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP4Q13115 394 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF276Q8N554 614 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC185Q8N715 623 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HDAC10Q969S8 669 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NDNQ99608 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BRD9Q9H8M2 597 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.49□□□□□ -1.37
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