RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SLX4Q8IY92 1834 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 WNK3Q9BYP7 1800 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CCL22O00626 93 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MAN1A2O60476 641 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ARIH2O95376 493 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PGK1P00558 417 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 AHSGP02765 367 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 LRPAP1P30533 357 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PCYT1AP49585 367 aa7□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 HMBOX1Q6NT76 420 aa7□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 LSMEM2Q8N112 164 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 RANBP9Q96S59 729 aa7□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ACOT9Q9Y305 439 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 DGKBQ9Y6T7 804 aa7□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 TOR1BO14657 336 aa7□□□□□ -1.29
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NEDD9-216ENST00000620854 MDM4O15151 490 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 INPP4BO15327 924 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CLOCKO15516 846 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TSPAN3O60637 253 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 COQ9O75208 318 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NCK1P16333 377 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 KCNA5P22460 613 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PRDX6P30041 224 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 C1QTNF8P60827 252 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TGFBIQ15582 683 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 DPYSL2Q16555 572 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 RBBP7Q16576 425 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CYP2A13Q16696 494 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 VPS26BQ4G0F5 336 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 DUSP28Q4G0W2 176 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SYPL2Q5VXT5 272 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ARL10Q8N8L6 244 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SNX19Q92543 992 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 DLG3Q92796 817 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ASB9Q96DX5 294 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MUC3BQ9H195 1237 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 FAIMQ9NVQ4 179 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 OAZ3Q9UMX2 235 aa7□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NRCAMQ92823 1304 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 FBP2O00757 339 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SBK3P0C264 359 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CPB1P15086 417 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NFKB1P19838 968 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NFKBIAP25963 317 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 MAGEA6P43360 314 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NR2C2P49116 596 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ENPEPQ07075 957 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ADIGQ0VDE8 80 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 BFSP2Q13515 415 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SV2CQ496J9 727 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 STEAP4Q687X5 459 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 REP15Q6BDI9 236 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 LZICQ8WZA0 190 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CASS4Q9NQ75 786 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PLK2Q9NYY3 685 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD9-216ENST00000620854 PCNAP12004 261 aa6.99□□□□□ -1.29
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