RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 PRKCGP05129 697 aa27.12■■□□□ 1.93
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BRD4-208ENST00000597315 MMP12P39900 470 aa27.12■■□□□ 1.93
BRD4-208ENST00000597315 BNIP3Q12983 259 aa27.12■■□□□ 1.93
BRD4-208ENST00000597315 DAAM2Q86T65 1068 aa27.12■■□□□ 1.93
BRD4-208ENST00000597315 CCDC13Q8IYE1 715 aa27.12■■□□□ 1.93
BRD4-208ENST00000597315 NDUFAF2Q8N183 169 aa27.12■■□□□ 1.93
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BRD4-208ENST00000597315 TEX26Q8N6G2 289 aa27.11■■□□□ 1.93
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BRD4-208ENST00000597315 H3BM21 787 aa27.1■■□□□ 1.93
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BRD4-208ENST00000597315 FTH1P19P0C7X4 201 aa27.1■■□□□ 1.93
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BRD4-208ENST00000597315 C11orf63Q6NUN7 778 aa27.1■■□□□ 1.93
BRD4-208ENST00000597315 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
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BRD4-208ENST00000597315 USP45Q70EL2 814 aa27.07■■□□□ 1.92
BRD4-208ENST00000597315 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
BRD4-208ENST00000597315 LRRN4Q8WUT4 740 aa27.07■■□□□ 1.92
BRD4-208ENST00000597315 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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BRD4-208ENST00000597315 BRD8Q9H0E9 1235 aa27.07■■□□□ 1.92
BRD4-208ENST00000597315 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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