RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587009.5

UBXN6-203, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 1,967 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-203ENST00000587009 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SNX32Q86XE0 403 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MIB1Q86YT6 1006 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 HPS6Q86YV9 775 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 KYQ8NBH2 561 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 GPR152Q8TDT2 470 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SPATA17Q96L03 361 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 NDNQ99608 321 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SLC12A8A0AV02 714 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PBX3P40426 434 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MAPKAPK2P49137 400 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SATB1Q01826 763 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 DSG1Q02413 1049 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 RING1Q06587 406 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 TAF10Q12962 218 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SERINC3Q13530 473 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 IHHQ14623 411 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 NXNQ6DKJ4 435 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 FAR2Q96K12 515 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SERPINI1Q99574 410 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SLC26A3P40879 764 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 LAMB3Q13751 1172 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 ACAP2Q15057 778 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 RASIP1Q5U651 963 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PGBD5Q8N414 524 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SGF29Q96ES7 293 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 VWA7Q9Y334 891 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MYLKQ15746 1914 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 AIM2O14862 343 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 NUDT2P50583 147 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 GSTA3Q16772 222 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 HDAC10Q969S8 669 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 CATSPER2Q96P56 530 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 ECSITQ9BQ95 431 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 VPS28Q9UK41 221 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 CCDC166P0CW27 439 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 FGFR3P22607 806 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PRAMEP78395 509 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SMARCB1Q12824 385 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 GPR17Q13304 367 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 DSELQ8IZU8 1212 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PEX13Q92968 403 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 VCX3BQ9H321 246 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MRGBPQ9NV56 204 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 STK39Q9UEW8 545 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 TTC3P53804 2025 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 BRCA2P51587 3418 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 MTMR11A4FU01 709 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 A8MT66 165 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 LDB2O43679 373 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 PRAMEF11O60813 436 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 SOAT2O75908 522 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 S1PR4O95977 384 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 HMBSP08397 361 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-203ENST00000587009 OR1E1P30953 314 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms