RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586654.5

EFTUD2-206, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-206ENST00000586654 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CST6Q15828 149 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ST3GAL2Q16842 350 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 DENND2CQ68D51 928 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CENPUQ71F23 418 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 PTPRN2Q92932 1015 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 BIRC7Q96CA5 298 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SPATA13Q96N96 652 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 VAT1Q99536 393 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 USP29Q9HBJ7 922 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 WASF3Q9UPY6 502 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 A0A1W2PP55 124 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 E7EVH7 732 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RNF103O00237 685 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SH3BP5O60239 455 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 OPA1O60313 960 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SASH3O75995 380 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 NEBLO76041 1014 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CER1O95813 267 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SPINK2P20155 84 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CD27P26842 260 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SLC8A1P32418 973 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 HSD17B3P37058 310 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 PSMD8P48556 350 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 MAPKAPK2P49137 400 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 IRAK1P51617 712 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 NDST2P52849 883 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ARL4CP56559 192 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TEAD4Q15561 434 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 C5orf22Q49AR2 442 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 C14orf80Q86SX3 495 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 NAXDQ8IW45 347 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 STK40Q8N2I9 435 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 NPWQ8N729 165 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ALG14Q96F25 216 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 FAM129BQ96TA1 746 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 LGMNQ99538 433 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 GAREM1Q9H706 876 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 IL21RQ9HBE5 538 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 NEU3Q9UQ49 428 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 DRGXA6NNA5 263 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RAMP2O60895 175 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CLDN11O75508 207 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ADH1BP00325 375 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 IGHV4-34P06331 123 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 ZNF883P0CG24 379 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 TPSB2P20231 275 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 C5AR1P21730 350 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 CCNCP24863 283 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 GRIA4P48058 902 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-206ENST00000586654 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms