RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583487.1

ERAL1-208, Transcript of Era like 12S mitochondrial rRNA chaperone 1, human

TSL 3

Gene ERAL1, Length 695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERAL1-208	ENST00000583487	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	LDB2	O43679	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SIN3B	O75182	1162 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PIGN	O95427	931 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	TRBC1	P01850	177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	CTSL	P07711	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PHB	P35232	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	CRADD	P78560	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MTM1	Q13496	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	GALNT3	Q14435	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	RASA2	Q15283	850 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	LEFTY1	O75610	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ACSL3	O95573	720 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	EGF	P01133	1207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PRNP	P04156	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	POLB	P06746	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SSTR1	P30872	391 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	GK	P32189	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	STX2	P32856	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SUOX	P51687	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	NAB1	Q13506	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	STAT4	Q14765	748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	POU6F1	Q14863	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PON2	Q15165	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	CDKN3	Q16667	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ACOX2	Q99424	681 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	MTG2	Q9H4K7	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	AGPS	O00116	658 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	SHBG	P04278	402 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	UGT2B4	P06133	528 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	BMP1	P13497	986 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	HLA-E	P13747	358 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ERAL1-208	ENST00000583487	TPH1	P17752	444 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms