RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 MAFKO60675 156 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PROS1P07225 676 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CD48P09326 243 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ALPPL2P10696 532 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TNNT1P13805 278 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DGKAP23743 735 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R40P59535 323 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 AP1S1P61966 158 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DAB2P98082 770 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SEMG2Q02383 582 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC3Q13217 504 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PTK2BQ14289 1009 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC14Q15048 493 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PDK2Q15119 407 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS13Q6UX07 377 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ASB12Q8WXK4 309 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CENPTQ96BT3 561 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF599Q96NL3 588 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PSKH2Q96QS6 385 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LAMA5O15230 3695 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MUSKO15146 869 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SPINT1O43278 529 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PIAS2O75928 621 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K6O95382 1288 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 C6P13671 934 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 JUPP14923 745 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 JUNDP17535 347 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CKMT2P17540 419 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IL4RP24394 825 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NFKBIAP25963 317 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HTR1BP28222 390 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MAN1A1P33908 653 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP25P42331 645 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MMP13P45452 471 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LIG3P49916 1009 aa8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-214ENST00000583153 MAXP61244 160 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DPYSL3Q14195 570 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FZD2Q14332 565 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FAXCQ5TGI0 409 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DENND2CQ68D51 928 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PARGQ86W56 976 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A45Q8N413 288 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CCNYQ8ND76 341 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LMX1AQ8TE12 382 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 VOPP1Q96AW1 172 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IFT43Q96FT9 208 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF670Q9BS34 389 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NT5MQ9NPB1 228 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NENFQ9UMX5 172 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQ67 120 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN11A1L157 253 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LRRD1A4D1F6 860 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FAM149AA5PLN7 773 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM38O00635 465 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC6O43699 453 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RFPL3O75679 317 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CSF2P04141 144 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PCCBP05166 539 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 C1SP09871 688 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ELFN1P0C7U0 828 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CDK4P11802 303 aa8.37□□□□□ -1.07
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