RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	SLC5A3	P53794	718 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SMTN	P53814	917 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TAP2	Q03519	686 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MPDZ	O75970	2070 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772		B4DGG1	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RASA4B	C9J798	803 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MCF2L	O15068	1137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RASA4	O43374	803 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HUS1	O60921	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	GLI1	P08151	1106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	NID1	P14543	1247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TYRP1	P17643	537 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CXCR3	P49682	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ANTXR2	P58335	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	COG7	P83436	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TRDN	Q13061	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PKP2	Q99959	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	UCK2	Q9BZX2	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PIN1P1	O15428	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN3	O15551	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	AP1G1	O43747	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SPAG6	O75602	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PCDH8	O95206	1070 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PAX1	P15863	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SRD5A1	P18405	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CYP11B2	P19099	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	IGFALS	P35858	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	GGT5	P36269	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CACNG1	Q06432	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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