RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa5.58□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CLIC4Q9Y696 253 aa5.58□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.58□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MAST3O60307 1309 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0U1RQV5 110 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PQH9 124 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC154A6NI56 674 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SYCE1LA8MT33 242 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 E7EWF7 191 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 E9PI62 339 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 H0Y8G0 127 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF263O14978 683 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 PPP6R2O75170 966 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF202O95125 648 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 RALBP11234 206 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 CYP2B6P20813 491 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 NR2F2P24468 414 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF8P28908 595 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINF1P36955 418 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SLC15A1P46059 708 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ALDH1A3P47895 512 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ACADVLP49748 655 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SLC7A2P52569 658 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 STX17P56962 302 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 BPIFB4P59827 614 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 CREMQ03060 361 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF543Q08ER8 600 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PMS2P11Q13670 270 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TUBB2AQ13885 445 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 GCKRQ14397 625 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 MPEG1Q2M385 716 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 GPAT3Q53EU6 434 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM31Q5JXX7 168 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ADGRF1Q5T601 910 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 RRAGAQ7L523 313 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 NEK8Q86SG6 692 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 LONP2Q86WA8 852 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D19Q8N5T2 526 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 NATD1Q8N6N6 113 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 OR8K5Q8NH50 307 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 LPPQ93052 612 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 FAM162AQ96A26 154 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 AZIN2Q96A70 460 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PGM2Q96G03 612 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 TUBB2BQ9BVA1 445 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 APOL6Q9BWW8 343 aa5.57□□□□□ -1.52
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CAPN3-211ENST00000562199 CD244Q9BZW8 370 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF576Q9H609 170 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 CABP5Q9NP86 173 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 SELENONQ9NZV5 590 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.57□□□□□ -1.52
CAPN3-211ENST00000562199 VPS51Q9UID3 782 aa5.57□□□□□ -1.52
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