RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	STAM	Q92783	540 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS33A	Q96AX1	596 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CDCA5	Q96FF9	252 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ERO1A	Q96HE7	468 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR24	Q96S15	920 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CD180	Q99467	661 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	NPAS1	Q99742	590 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FSD1	Q9BTV5	496 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf21	Q9H246	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	POT1	Q9NUX5	634 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD8	Q9NX08	183 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CD207	Q9UJ71	328 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HPSE	Q9Y251	543 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX12	O00623	359 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAMP1	O15126	338 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNL1	O43396	289 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRY2	O43597	315 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SOCS5	O75159	536 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RTN2	O75298	545 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PALM	O75781	387 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMTA2	O94983	1202 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	APBB3	O95704	486 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-CO3	P00414	261 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FYN	P06241	537 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP21A2	P08686	494 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SPARC	P09486	303 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SFTPC	P11686	197 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	COX7A2	P14406	83 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PTAFR	P25105	342 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP3	P42574	277 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DIO1	P49895	249 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH15	P55291	814 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HTD2	P86397	168 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN1B	Q07699	218 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	COASY	Q13057	564 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MTA1	Q13330	715 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TRADD	Q15628	312 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MEP1B	Q16820	701 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND2C	Q68D51	928 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MTFR2	Q6P444	385 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL35	Q6PF15	583 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGB4	Q8WW32	186 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	NCSTN	Q92542	709 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ELP4	Q96EB1	424 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MASTL	Q96GX5	879 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94

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