RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 RTKNQ9BST9 563 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GAREM1Q9H706 876 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DONSONQ9NYP3 566 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KLF15Q9UIH9 416 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LRRD1A4D1F6 860 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 C10orf142B7Z368 130 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 H0Y8X5 98 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SLC7A4O43246 635 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SPOPO43791 374 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MAFKO60675 156 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MTA2O94776 668 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LCA5LO95447 670 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PEX11BO96011 259 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KRT1P04264 644 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SYPP08247 313 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KRT7P08729 469 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ADH6P28332 368 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MAN1A1P33908 653 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 HOXD12P35452 270 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ARHGAP25P42331 645 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PI4KAP42356 2102 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SCNN1BP51168 640 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CCR5P51681 352 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NEK3P51956 506 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LIMK1P53667 647 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CLDN2P57739 230 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GBE1Q04446 702 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 IL10RBQ08334 325 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FGL2Q14314 439 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PDK2Q15119 407 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 HLA-BQ31612 363 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NPNTQ6UXI9 565 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SRLQ86TD4 932 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TTC7BQ86TV6 843 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PGBD5Q8N414 524 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LZTR1Q8N653 840 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DEFB124Q8NES8 71 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FAM71BQ8TC56 605 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DESI2Q9BSY9 194 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 HDAC8Q9BY41 377 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 INTUQ9ULD6 942 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ALG6Q9Y672 507 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.31□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 A0A1W2PR77 199 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 IGLON5A6NGN9 336 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 A8MX80 341 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NEMP1O14524 444 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RAD51BO15315 384 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LATO43561 262 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SH3BP5O60239 455 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MMP20O60882 483 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 OPHN1O60890 802 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KRT10P13645 584 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CD59P13987 128 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SDHBP21912 280 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CD38P28907 300 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CDC25BP30305 580 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MARCKSL1P49006 195 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 C21orf59P57076 290 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DYNLT1P63172 113 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RAD51Q06609 339 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PTPRRQ15256 657 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TEAD4Q15561 434 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZNF284Q2VY69 593 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PPM1JQ5JR12 505 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KAZNQ674X7 775 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.3□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms