RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	RHD	Q02161	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	NUCB1	Q02818	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GPNMB	Q14956	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557		Q9Y3F1	56 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CABYR	O75952	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MMP3	P08254	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MYL3	P08590	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	P2RX3	P56373	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CBFB	Q13951	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ASIC2	Q16515	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PRY	O14603	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SPTLC2	O15270	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	IL18RAP	O95256	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CA3	P07451	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	DAG1	Q14118	895 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	P3H1	Q32P28	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ESR2	Q92731	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GJA10	Q969M2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TTC14	Q96N46	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	WDR24	Q96S15	920 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ABCB11	O95342	1321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CYTH3	O43739	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC28A2	O43868	658 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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